Las estructuras del Proyecto Ecocasas están ubicadas en lugares de alto valor ecológico e histórico y coexisten con la naturaleza, sus comunidades y biodiversidad. Todas ellas están distribuidas en varias regiones de las islas de Puerto Rico y, además de resguardar un legado arquitectónico y cultural, sirven para promover la educación, la sostenibilidad, agroecología, reforestación y gastronomía.
Brindando una oportunidad de estadía ecológica, Proyecto Ecocasas ha habilitado estructuras existentes en algunas áreas naturales protegidas manejadas por Para la Naturaleza.